O HDES aderiu de forma voluntária ao processo de Acreditação, modelo inglês CHKS (Comparative Health Knowledge System), em junho de 2004, tendo em conta a necessidade de construção de um conjunto de estruturas e processos organizacionais, assim como a avaliação, revisão e manutenção destes de forma a permitir uma prestação de cuidados de saúde de excelência.
A Acreditação é um processo de reconhecimento de que determinada Instituição cumpre critérios específicos e atinge determinados padrões de qualidade, sendo uma entidade independente e não governamental que avalia os serviços prestados pela instituição de saúde, de forma a determinar se esta corresponde às exigências de um conjunto de normas destinadas a melhorar a qualidade dos cuidados de saúde.
O Hospital obteve a 1ª Acreditação em novembro de 2007, mantendo o processo até à data.
